性質(zhì)不同。司法機關(guān)是行使司法權(quán)的國家機關(guān)，是國家機構(gòu)的基本組成部分，是依法成立的行使相關(guān)國家職權(quán)的司法組織。公安機關(guān)是人民政府的重要組成部分，是國家的行政機關(guān)。構(gòu)成不同。在中國，司法機關(guān)指人民法院、人民檢察院兩大類。另外，公安機關(guān)可以被認為是司法機關(guān)的一部分，在行使行政職能時則不屬于司法機關(guān)。國家安全機關(guān)、監(jiān)獄偵查部門、軍隊保衛(wèi)部門等其他負有刑事偵查權(quán)的機關(guān)在進行刑事訴訟的過程中其角色同公安機關(guān)。職能不同。最高人民法院是中華人民共和國最高審判機關(guān)。公安機關(guān)是政府的一個職能部門，依法管理社會治安。

一、性質(zhì)不同。仲裁是由仲裁機構(gòu)即仲裁委員會受理。仲裁委員會是由省、自治區(qū)、直轄市人民政府所在地的市或其他設區(qū)的市的人民政府組織有關(guān)部門和商會統(tǒng)一組建的專門仲裁機構(gòu)，而審判則由人民法院負責，法院是國家機器的重要組成部分，是代表國家行使審判權(quán)的機關(guān)。 二、對案件的管轄不同。仲裁機構(gòu)即仲裁委員會是根據(jù)當事人雙方自愿達成的仲裁協(xié)議受理案件，其對案件的管轄權(quán)是基于雙方當事人的授權(quán)。人民法院則是強制管轄，只要一方當事人向有管轄權(quán)的人民法院提起訴訟，人民法院就可依法受理案件。 三、審理組織的組成原則不同。組成仲裁庭的仲裁員是由當事人各方選定或共同選定或委托仲裁機構(gòu)指定，其組成是基于當事人的選擇，而審判庭的組成則是由人民法院指定，依法定程序申請回避，是否回避由人民法院決定。 四、仲裁庭審理案件一般不公開進行，案情不公開，裁決不公開，有利于保護當事人的商業(yè)秘密和商業(yè)信譽，人民法院審理案件實行公開審理原則，但依法不應公開審理的除外。 五、依法實行一裁終局，裁決一經(jīng)仲裁庭作出即發(fā)生法律效力，當事人不能上訴，而法院審判則實行兩審終審制，當事人對一審法院判決不服可上訴于上一級人民法院。