1、法律規(guī)定不同。依據(jù)國家法律，宅基地不能上市交易，所以宅基地證不能過戶。而房產(chǎn)是可以進行市場交易的所以房產(chǎn)證可以過戶。2土地性質(zhì)不同。土地的獲取方式不同。土地的發(fā)證機關(guān)也不一樣。農(nóng)村宅基地產(chǎn)權(quán)確權(quán)證書相對于房產(chǎn)證是有著區(qū)別的，房產(chǎn)證擁有者可以對房屋進行任意處分，它的買賣也不受到身份的限制。而農(nóng)村宅基地產(chǎn)權(quán)確權(quán)證書則只是確認對宅基地的使用權(quán)，對于宅基地的處分會受到身份的限制，以及在買賣后不能再申請新的宅基地。

房屋所有權(quán)證和集體土地使用證的區(qū)別： 1.產(chǎn)權(quán)性質(zhì)不同。房產(chǎn)證是購房者通過交易，取得房屋的合法所有權(quán)，可依法對所購房屋行使占有、使用、收益和處分的權(quán)利的證件；集體土地使用證是集體土地所有人依法對集體土地享有占有、收益和處分權(quán)利的合法憑證。 2.所有權(quán)主體不同。房產(chǎn)證是對特定房屋所有權(quán)歸屬的書面證明，并可記載特定房屋共有狀況以及是否設(shè)定擔保物權(quán)等狀況；凡是土地家庭聯(lián)產(chǎn)承包中未打破村民小組(原生產(chǎn)隊)界線，不論是以村的名義還是以組的名義與農(nóng)戶簽訂承包合同，土地應確認給村民小組農(nóng)民集體所有。 3.證件作用不同。房產(chǎn)證主要在房屋登記事務范疇中發(fā)揮作用，并且主要是為了保證登記活動的秩序與安全；集體土地使用證也是國家保護的土地使用權(quán)證書，持有人有使用和收益等權(quán)益。