（一）股權轉讓所得是指股權轉讓價減除股權成本價后的差額。股權轉讓價是指股權轉讓人就轉讓的股權所收取的包括現(xiàn)金、非貨幣資產(chǎn)或者權益等形式的金額。如被持股企業(yè)有未分配利潤或稅后提存的各項金額等，股權轉讓人隨股權一并轉讓該股東留存收益權的金額，不得從股權轉讓價中扣除。股權成本價是指股權轉讓人投資入股時向被投資企業(yè)實際交付的出資金額，或購買該股權時向該股權的原轉讓人實際支付的股權轉讓金額。（二）根據(jù)《財政部國家稅務總局關于企業(yè)重組業(yè)務企業(yè)所得稅處理若干問題的通知》（財稅〔2009〕59號）的規(guī)定，股權收購區(qū)分不同條件分別適用一般性稅務處理規(guī)定和特殊性稅務處理規(guī)定。1、適用一般性稅務處理規(guī)定：企業(yè)股權收購、資產(chǎn)收購重組交易，相關交易應按以下規(guī)定處理：（1）被收購方應確認股權、資產(chǎn)轉讓所得或損失。（2）收購方取得股權或資產(chǎn)的計稅基礎應以公允價值為基礎確定。（3）被收購企業(yè)的相關所得稅事項原則上保持不變。 2、適用特殊性稅務處理規(guī)定：股權收購，收購企業(yè)購買的股權不低于被收購企業(yè)全部股權的75%，且收購企業(yè)在該股權收購發(fā)生時的股權支付金額不低于其交易支付總額的85%，可以選擇按以下規(guī)定處理：（1）被收購企業(yè)的股東取得收購企業(yè)股權的計稅基礎，以被收購股權的原有計稅基礎確定。（2）收購企業(yè)取得被收購企業(yè)股權的計稅基礎，以被收購股權的原有計稅基礎確定。（3）收購企業(yè)、被收購企業(yè)的原有各項資產(chǎn)和負債的計稅基礎和其他相關所得稅事項保持不變。（三）《國家稅務總局關于貫徹落實企業(yè)所得稅法若干稅收問題的通知》（國稅函〔2010〕79號）第三條規(guī)定：企業(yè)轉讓股權收入，應于轉讓協(xié)議生效、且完成股權變更手續(xù)時，確認收入的實現(xiàn)。《企業(yè)所得稅法》第五十四條規(guī)定：企業(yè)所得稅分月或者分季預繳。企業(yè)應當自月份或者季度終了之日起十五日內(nèi)，向稅務機關報送預繳企業(yè)所得稅納稅申報表，預繳稅款。企業(yè)應當自年度終了之日起五個月內(nèi)，向稅務機關報送年度企業(yè)所得稅納稅申報表，并匯算清繳，結清應繳應退稅款。因此，企業(yè)應于轉讓協(xié)議生效且完成股權變更手續(xù)時，確認收入的實現(xiàn)。應當在當月（季）申報預繳企業(yè)所得稅，年終匯算清繳。這是股權轉讓中的企業(yè)所得稅是如何計算的情況。