企業(yè)的商業(yè)秘密被侵犯，應(yīng)視不同情況，分別向不同部門起訴，尋求司法保護(hù)。第一，向仲裁機(jī)構(gòu)申請仲裁解決。 企業(yè)的商業(yè)秘密被侵犯，如果此前企業(yè)與侵權(quán)人之間簽訂了《合同》，并且雙方自愿達(dá)成仲裁協(xié)議的，可依據(jù)《中華人民共和國仲裁法》向當(dāng)?shù)刂俨脵C(jī)構(gòu)或者雙方仲裁協(xié)議中約定的仲裁機(jī)構(gòu)申請仲裁。第二，向工商行政管理部門投訴。侵犯商業(yè)秘密往往同時(shí)構(gòu)成不正當(dāng)競爭行為，因此可以要求工商管理部門對不正當(dāng)競爭行為進(jìn)行監(jiān)督檢查。第三，向人民法院起訴。企業(yè)的商業(yè)秘密被侵犯，可以直接向人民法院起訴。第四，協(xié)商解決。商業(yè)秘密糾紛屬民事糾紛，企業(yè)單位的商業(yè)秘密受到侵害時(shí)，被侵害人可以與侵害人進(jìn)行協(xié)商，要求其停止侵害并做適當(dāng)賠償，以維護(hù)自身的正當(dāng)權(quán)益。

企業(yè)商業(yè)秘密被侵犯的維權(quán)措施有： 1、到人民政府監(jiān)督檢查部門投訴； 2、到仲裁機(jī)構(gòu)申請仲裁； 3、到人民法院起訴?！吨腥A人民共和國反不正當(dāng)競爭法》第二十一條規(guī)定，經(jīng)營者以及其他自然人、法人和非法人組織違反本法第九條規(guī)定侵犯商業(yè)秘密的，由監(jiān)督檢查部門責(zé)令停止違法行為，沒收違法所得，處十萬元以上一百萬元以下的罰款；情節(jié)嚴(yán)重的，處五十萬元以上五百萬元以下的罰款。第三十二條第一款規(guī)定，在侵犯商業(yè)秘密的民事審判程序中，商業(yè)秘密權(quán)利人提供初步證據(jù)，證明其已經(jīng)對所主張的商業(yè)秘密采取保密措施，且合理表明商業(yè)秘密被侵犯，涉嫌侵權(quán)人應(yīng)當(dāng)證明權(quán)利人所主張的商業(yè)秘密不屬于本法規(guī)定的商業(yè)秘密。