農(nóng)村土地流轉(zhuǎn)糾紛的原因有：1.土地承包權(quán)不清。土地流轉(zhuǎn)過程中農(nóng)戶間的糾紛可以歸結(jié)為承包權(quán)不清引起的經(jīng)濟(jì)糾紛。2.農(nóng)民缺乏維權(quán)意識(shí)和法律知識(shí)。在生活實(shí)踐中，大多數(shù)農(nóng)民不熟悉土地流轉(zhuǎn)的方式，大多采用口頭協(xié)議形式，缺乏必要的書面形式。3.行政干預(yù)、權(quán)力濫用侵蝕農(nóng)民利益。很多農(nóng)村土地糾紛產(chǎn)生是因?yàn)榇寮?jí)組織和政府職能部門的權(quán)力濫用，損害農(nóng)民利益。4.管理機(jī)制不健全。農(nóng)村土地流轉(zhuǎn)糾紛的解決方法是：1.明晰產(chǎn)權(quán)，協(xié)調(diào)利益關(guān)系。明晰的產(chǎn)權(quán)關(guān)系和產(chǎn)權(quán)各項(xiàng)權(quán)能主體權(quán)利義務(wù)范圍的明確界定是實(shí)現(xiàn)農(nóng)村土地流轉(zhuǎn)的必要前提。2.完善對(duì)被征地農(nóng)民的補(bǔ)償安置制度，健全最低生活保障體系。完善農(nóng)地非農(nóng)化過程中對(duì)被征地農(nóng)民的補(bǔ)償安置制度，制定合理可行的農(nóng)地補(bǔ)償標(biāo)準(zhǔn)。3.加強(qiáng)對(duì)失地農(nóng)民的就業(yè)培訓(xùn)，增強(qiáng)其再就業(yè)能力。4.進(jìn)行適當(dāng)?shù)木蜆I(yè)安置，穩(wěn)定承包關(guān)系。

發(fā)生宅基地糾紛可以通過以下方式解決： (1)協(xié)商解決《土地管理法》第14條第1款規(guī)定：”土地所有權(quán)和使用權(quán)爭議，由當(dāng)事人協(xié)商解決?！皳?jù)此規(guī)定，公民之間發(fā)生的宅基地糾紛，應(yīng)當(dāng)先通過協(xié)商的方式加以解決。 (2)行政解決《土地管理法》第14條第2款規(guī)定：”個(gè)人之間，個(gè)人與單位之間的爭議，由鄉(xiāng)級(jí)人民政府或者縣級(jí)以上人民政府處理。“ (3)司法解決《土地管理法》第14條第3款規(guī)定：”當(dāng)事人對(duì)有關(guān)人民政府的處理決定不服的，可以在接到處理決定通知之日起30日內(nèi)，向人民法院起訴?！?/p>