增值稅發(fā)票超過認(rèn)證時(shí)間了，按以下情況處理： 1、對增值稅一般納稅人發(fā)生真實(shí)交易但由于客觀原因造成增值稅扣稅憑證逾期的，經(jīng)主管稅務(wù)機(jī)關(guān)審核、逐級上報(bào)，由國家稅務(wù)總局認(rèn)證、稽核比對后，對比對相符的增值稅扣稅憑證，允許納稅人繼續(xù)抵扣其進(jìn)項(xiàng)稅額。客觀原因如下： （1）因自然災(zāi)害、社會(huì)突發(fā)事件等不可抗力因素造成增值稅扣稅憑證逾； （2）增值稅扣稅憑證被盜、搶，或者因郵寄丟失、誤遞導(dǎo)致逾期； （3）有關(guān)司法、行政機(jī)關(guān)在辦理業(yè)務(wù)或者檢查中，扣押增值稅扣稅憑證，納稅人不能正常履行申報(bào)義務(wù)，或者稅務(wù)機(jī)關(guān)信息系統(tǒng)、網(wǎng)絡(luò)故障，未能及時(shí)處理納稅人網(wǎng)上認(rèn)證數(shù)據(jù)等導(dǎo)致增值稅扣稅憑證逾期； （4）買賣雙方因經(jīng)濟(jì)糾紛，未能及時(shí)傳遞增值稅扣稅憑證，或者納稅人變更納稅地點(diǎn)，注銷舊戶和重新辦理稅務(wù)登記的時(shí)間過長，導(dǎo)致增值稅扣稅憑證逾期； （5）由于企業(yè)辦稅人員傷亡、突發(fā)危重疾病或者擅自離職，未能辦理交接手續(xù)，導(dǎo)致增值稅扣稅憑證逾期； 2、除1中的（1）-（5）情形原因外，將發(fā)票的價(jià)稅合計(jì)金額計(jì)入相關(guān)的成本或費(fèi)用中。 3、相關(guān)規(guī)定，國稅總局發(fā)的國稅函【2009】617號文： （1）增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的增值稅專用發(fā)票、公路內(nèi)河貨物運(yùn)輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票和機(jī)動(dòng)車銷售統(tǒng)一發(fā)票，應(yīng)在開具之日起180日內(nèi)到稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理認(rèn)證，并在認(rèn)證通過的次月申報(bào)期內(nèi)，向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。 （2）實(shí)行海關(guān)進(jìn)口增值稅專用繳款書（以下簡稱海關(guān)繳款書）“先比對后抵扣”管理辦法的增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的海關(guān)繳款書，應(yīng)在開具之日起180日內(nèi)向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)報(bào)送《海關(guān)完稅憑證抵扣清單》（包括紙質(zhì)資料和電子數(shù)據(jù)）申請稽核比對。 未實(shí)行海關(guān)繳款書“先比對后抵扣”管理辦法的增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的海關(guān)繳款書，應(yīng)在開具之日起180日后的第一個(gè)納稅申報(bào)期結(jié)束以前，向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。 （3）增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的增值稅專用發(fā)票、公路內(nèi)河貨物運(yùn)輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票、機(jī)動(dòng)車銷售統(tǒng)一發(fā)票以及海關(guān)繳款書，未在規(guī)定期限內(nèi)到稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理認(rèn)證、申報(bào)抵扣或者申請稽核比對的，不得作為合法的增值稅扣稅憑證，不得計(jì)算進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣。