公司設(shè)立協(xié)議與公司章程的目標(biāo)是一致的，都是為了設(shè)立公司。兩者在內(nèi)容上也常有類同或相通之處，例如都約定公司名稱、注冊資本、經(jīng)營范圍、股東出資與比例、出資形式等等。但是，兩者在法律性質(zhì)和功能上，還是有著巨大的差別： (一)公司章程是公司必備文件，而公司設(shè)立協(xié)議則是任意性文件。 公司章程是我國公司法強制要求的公司必備文件。沒有公司章程，公司就不能成立。而除了外商投資企業(yè)要求有合同以及股份有限公司要求有發(fā)起人協(xié)議外，《中華人民共和國公司法》并沒有要求公司必須具有設(shè)立協(xié)議。 (二)公司設(shè)立協(xié)議與公司章程的效力范圍不同。 根據(jù)《中華人民共和國公司法》的規(guī)定，公司章程對公司、股東、董事、監(jiān)事、高級管理人員均具有約束力。也就是說，公司章程的作用范圍包括股東、公司以及公司內(nèi)部組織機構(gòu)與人員。而公司設(shè)立協(xié)議僅僅是股東之間的任意性合同，需遵守合同相對性的原則，其作用范圍僅限于簽約的主體之間。 (三)公司設(shè)立協(xié)議與公司章程的效力期限不同。 公司設(shè)立協(xié)議主要是在公司設(shè)立期間發(fā)生法律效力，所調(diào)整的是公司設(shè)立過程中的法律關(guān)系與法律行為。

公司設(shè)立協(xié)議與公司章程的區(qū)別如下： 1、公司章程是公司必備文件，而公司設(shè)立協(xié)議則是任意性文件； 2、公司設(shè)立協(xié)議與公司章程的效力范圍不同； 3、公司設(shè)立協(xié)議與公司章程的效力期限不同；等等。