農(nóng)村集體土地使用證辦理程序如下： 1、土地使用人向土地所在地的縣級(jí)人民政府土地行政主管部門申請(qǐng)辦理土地使用證； 2、提交申請(qǐng)表以及其他的材料； 3、審核材料； 4、縣級(jí)人民政府登記造冊(cè)、核發(fā)集體土地使用證。 根據(jù)《土地管理法實(shí)施條例》第四條第二款、第三款的規(guī)定，農(nóng)民集體所有的土地依法用于非農(nóng)業(yè)建設(shè)的，由土地使用者向土地所在地的縣級(jí)人民政府土地行政主管部門提出土地登記申請(qǐng)，由縣級(jí)人民政府登記造冊(cè)，核發(fā)集體土地使用權(quán)證書，確認(rèn)建設(shè)用地使用權(quán)。 設(shè)區(qū)的市人民政府可以對(duì)市轄區(qū)內(nèi)農(nóng)民集體所有的土地實(shí)行統(tǒng)一登記。

農(nóng)村集體土地使用權(quán)流轉(zhuǎn)模式有： 1、互換土地，是農(nóng)村集體經(jīng)濟(jì)組織內(nèi)部的農(nóng)戶，為方便耕種和各自的需要，對(duì)各自土地的承包經(jīng)營(yíng)權(quán)進(jìn)行的簡(jiǎn)單交換，是促進(jìn)農(nóng)村規(guī)模化、產(chǎn)業(yè)化、集約化經(jīng)營(yíng)的必由之路； 2、交租； 3、入股，亦稱“股田制”或股份合作經(jīng)營(yíng)，是指在堅(jiān)持承包戶自愿的基礎(chǔ)上，將承包土地經(jīng)營(yíng)權(quán)作價(jià)入股，建立股份公司； 4、宅基地?fù)Q住房，承包地?fù)Q社保； 5、股份合作。