根據(jù)有關(guān)法規(guī)、規(guī)章，增值稅專用發(fā)票的存根是開票方留存?zhèn)洳榈膽{據(jù)，發(fā)票聯(lián)是收票方付款的憑據(jù)，抵扣聯(lián)是收票方辦理扣稅手續(xù)的憑據(jù)。僅有增值稅發(fā)票不能認(rèn)定付款事實(shí)。 僅有增值稅發(fā)票不能認(rèn)定付款事實(shí)，因?yàn)樵谑褂靡话惆l(fā)票進(jìn)行買賣交易的場合，通常情況下是在付款后再開具發(fā)票，或是開具發(fā)票行為與付款行為同時(shí)進(jìn)行，發(fā)票在此種情況下可以作為付款憑證，證明已付款的事實(shí)。 但在使用增值稅發(fā)票進(jìn)行交易的場合，這種專用發(fā)票具有證明銷售方已盡納稅義務(wù)和購買方進(jìn)項(xiàng)稅額的作用，因而它就又具有了確定最終應(yīng)付價(jià)款準(zhǔn)確數(shù)額的作用，但并不能起到物權(quán)憑證的作用。以增值稅發(fā)票證明付款的事實(shí)，仍需另外舉證補(bǔ)強(qiáng)，以其他證據(jù)如進(jìn)帳單、支票存根等付款憑證來作為已付款的依據(jù)。

發(fā)票作為一種憑證，記載的主要是商(產(chǎn))品銷售、提供或者接受服務(wù)等經(jīng)營性活動(dòng)的狀況，實(shí)踐中存在一方收到對(duì)方開具的發(fā)票后再另行付款的情況。因此，僅僅只有發(fā)票并不能充分證明已付款。 對(duì)于證明已付款的舉證責(zé)任，一般有： 1、一方當(dāng)事人認(rèn)為已履行給付貨款義務(wù)并提供發(fā)票，對(duì)方不承認(rèn)的，應(yīng)由不予承認(rèn)一方承擔(dān)舉證責(zé)任; 2、另一方當(dāng)事人提供的相反證據(jù)不足以反駁的，法院可以確認(rèn)發(fā)票作為付款憑證的證明力。