1、查明事實(shí)階段。即查清違章建筑形成的時間、原因、結(jié)構(gòu)、面積、用途，是否存在民事糾紛，是否存在同時違反兩個以上的行政法律規(guī)范的情形，是否已經(jīng)行政執(zhí)法機(jī)關(guān)查處等。對已經(jīng)查處的按查處的結(jié)論辦理，對未經(jīng)查處的，進(jìn)入下階段。 2、處理和處罰階段。第一步按時間分類分流。根據(jù)各地城市規(guī)劃的具體時間合情合理地確定違法建筑的時間界限。第二步，按是否存在違章建筑的行為同時違反了兩個以上的行政法律規(guī)范的情形為標(biāo)準(zhǔn)分類分流。第三步，作出處理或處罰決定。 然后根據(jù)處理或處罰決定分別處置，對補(bǔ)辦手續(xù)的，進(jìn)入補(bǔ)辦手續(xù)階段;對處以沒收或限期拆除的，進(jìn)入執(zhí)行階段。 3、補(bǔ)辦手續(xù)階段。對依法應(yīng)當(dāng)直接補(bǔ)辦手續(xù)或經(jīng)過處罰后要求補(bǔ)辦手續(xù)的，由違章建筑的當(dāng)事人到相關(guān)行政部門補(bǔ)辦手續(xù)。 4、簽定安置補(bǔ)償協(xié)議階段。在此階段，由拆遷雙方自行確定安置補(bǔ)償方案。對協(xié)商不成的，經(jīng)一方當(dāng)事人申請可進(jìn)入行政裁決階段;對達(dá)成協(xié)議后，被拆遷人拒不履行的，經(jīng)拆遷人申請，可進(jìn)入強(qiáng)制拆遷階段，由人民法院依法強(qiáng)制執(zhí)行。 5、行政裁決階段。對拆遷當(dāng)事人經(jīng)協(xié)商未能達(dá)協(xié)議，經(jīng)一方當(dāng)事人的申請行政裁決的，行政機(jī)關(guān)應(yīng)予受理。行政機(jī)關(guān)在受理后，應(yīng)及時將申請人的申請書及證據(jù)發(fā)送給對方當(dāng)事人，并告知其權(quán)利與義務(wù)。行政機(jī)關(guān)在查明事實(shí)的基礎(chǔ)上，在法定期限內(nèi)就安置補(bǔ)償作出行政裁決決定，并明確當(dāng)事人搬遷的期限。 6、強(qiáng)制執(zhí)行階段。對于被拆遷人(即違章建筑的當(dāng)事人)不履行安置補(bǔ)償協(xié)議或安置補(bǔ)償裁決的，經(jīng)申請，可由人民法院依民事司法強(qiáng)制執(zhí)行程序或行政司法強(qiáng)制執(zhí)行程序強(qiáng)制執(zhí)行，亦可由人民政府責(zé)成相關(guān)行政部門組織行政強(qiáng)制拆遷，強(qiáng)制被拆遷人搬遷，并拆除其建筑物等。

《行政處罰法》第四十二條規(guī)定行政機(jī)關(guān)作出責(zé)令停產(chǎn)停業(yè)、吊銷許可證或者執(zhí)照、較大數(shù)額罰款等行政處罰決定之前，應(yīng)當(dāng)告知當(dāng)事人有要求舉行聽證的權(quán)利;當(dāng)事人要求聽證的，行政機(jī)關(guān)應(yīng)當(dāng)組織聽證。當(dāng)事人不承擔(dān)行政機(jī)關(guān)組織聽證的費(fèi)用。