(1)處理機關(guān)不同。行政復議的處理機關(guān)是行政機關(guān)；行政訴訟的處理機關(guān)是人民法院，即司法機關(guān)。 (2)性質(zhì)不同。行政復議機關(guān)的復議行為屬于行政行為，它是一種行政機關(guān)內(nèi)部的層級監(jiān)督制度；人民法院審理行政案件的活動屬于司法活動，是人民法院對行政機關(guān)的監(jiān)督活動。 (3)調(diào)整的法律不同。行政復議受行政程序法即行政復議法調(diào)整；行政訴訟則受訴訟法即行政訴訟法支配。

二者的區(qū)別： 1、審理機關(guān)不同。行政復議是由作出具體行政行為的行政機關(guān)的上級行政機關(guān)審理，而行政訴訟則是由作出具體行政行為的行政機關(guān)所在地的人民法院審理。 2、法律依據(jù)不同。行政復議依據(jù)的是《行政復議法》及《行政復議法實施條例》，而行政訴訟則是依據(jù)《行政訴訟法》。 3、程序不同。行政復議只有一級，即行政復議決定作出后行政復議程序即終止，對行政復議決定不服只能依法向人民法院提起行政訴訟。而行政訴訟則對一審法院作出判決不服還可向上級法院提起上訴。在審理過程中，行政復議一般是書面審，只有在必要時，才可舉行聽證或當面聽取有關(guān)人員意見。而行政訴訟除特殊案件外，一般均可公開審理，且具有交換證據(jù)、法庭調(diào)查、質(zhì)證、辯論等程序。 行政復議實行行政首長負責制，即行政復議結(jié)論的決定權(quán)由行政機關(guān)層級審批，行政首長最終決定。而行政訴訟實行合議制。 4、結(jié)案方式不同。行政復議可以由行政機關(guān)為申請人和被申請人調(diào)解，申請人與本申請人也可自愿達成和解，而行政訴訟不適用調(diào)解。 5、審理的內(nèi)容不同。行政復議既要審查具體行政行為的合法性，也要審查其適當性，并可依法作出復議決定。而行政訴訟原則上只審查具體行政行為的合法性，雖也對適當性進行審查，但一般不就行政機關(guān)的具體行政行為的適當性作出裁決。 6、行政復議不收費，行政訴訟收費。