總公司撤銷分公司程序如下： (一)注銷(分)公司國、地稅登記證 注銷(分)公司國稅、地稅登記證所需資料： 1、國地稅正副本; 2、本年度匯算清繳報告; 3、注銷報告; 4、填寫稅務注銷表格(如果有未用完發(fā)票要先核銷)。 (二)到公司主管工商局辦理公司注銷備案 所需資料： 1、公司營業(yè)執(zhí)照復印件; 2、公司股東會決議(內容就是注銷公司，成立清算小組); 3、公司原始檔案; 4、到工商局領取表格; 注銷(分)公司國、地稅登記證和到公司主管工商局辦理公司注銷備案可以同時辦理。 (三)登報公告 所需資料： 1、公司營業(yè)執(zhí)照復印件、公司股東會決議復印件; 2、法定代表人身份證復印件; 3、公告內容。 (四)登報45日后，再次到工商局辦理注銷申請 所需資料： 1、公司營業(yè)執(zhí)照原件(正副本); 2、稅務注銷證明文件; 3、公司股東會決議; 4、公司清算報告; 5、工商局領取的表格; 6、公司原始檔案。 (五)到質監(jiān)局注銷代碼證 所需資料： 1、營業(yè)執(zhí)照注銷證明文件; 2、代碼證原件(正副本)。

《中華人民共和國公司登記管理條例》第四十三條 公司申請注銷登記，應當提交下列文件： (一)公司清算組負責人簽署的注銷登記申請書; (二)人民法院的破產裁定、解散裁判文書，公司依照《公司法》作出的決議或者決定，行政機關責令關閉或者公司被撤銷的文件; (三)股東會、股東大會、一人有限責任公司的股東、外商投資的公司董事會或者人民法院、公司批準機關備案、確認的清算報告; (四)《企業(yè)法人營業(yè)執(zhí)照》; (五)法律、行政法規(guī)規(guī)定應當提交的其他文件。國有獨資公司申請注銷登記，還應當提交國有資產監(jiān)督管理機構的決定，其中，國務院確定的重要的國有獨資公司，還應當提交本級人民政府的批準文件。有分公司的公司申請注銷登記，還應當提交分公司的注銷登記證明。