不合法。無論以什么形式解除或終止勞動(dòng)關(guān)系，單位都沒有權(quán)利扣押勞動(dòng)者的檔案。根據(jù)國家勞動(dòng)部、國家檔案局在《企業(yè)職工檔案管理工作規(guī)定》的規(guī)定：職工調(diào)動(dòng)、辭職、解除勞動(dòng)合同或被開除、辭退等，應(yīng)由職工所在單位在一個(gè)月內(nèi)將其檔案轉(zhuǎn)交其新的工作單位或其戶口所在地的街道勞動(dòng)（組織人事）部門。同時(shí)規(guī)定，轉(zhuǎn)遞檔案應(yīng)遵守下列規(guī)定：（一）通過機(jī)要交通或派專人送取，不準(zhǔn)郵寄或交本人自帶。（二）對轉(zhuǎn)出的檔案，必須按統(tǒng)一規(guī)定的“企業(yè)職工檔案轉(zhuǎn)遞通知單”的項(xiàng)目登記，并密封包裝。（三）對轉(zhuǎn)出的材料，不得扣留或分批轉(zhuǎn)出。（四）接收單位收到檔案經(jīng)核對無誤后，應(yīng)在回執(zhí)上簽名蓋章，并將回執(zhí)立即退回，逾期一個(gè)月轉(zhuǎn)出單位未收到回執(zhí)應(yīng)及時(shí)詢問，以防丟失。因此，即使員工在離職過程中有違約行為，單位也不能以任何理由扣押檔案。雖然檔案問題不屬于《勞動(dòng)法》上的問題，因檔案問題發(fā)生爭議無法提起勞動(dòng)仲裁或訴訟，但是，根據(jù)勞動(dòng)部辦公廳1994年的精神，與單位解除勞動(dòng)合同后，如果單位不移交檔案給職工造成損失的，可以按勞動(dòng)爭議提交仲裁，由單位給予賠償。如果發(fā)生單位扣押個(gè)人檔案的情況，也可以向勞動(dòng)行政部門和國家有關(guān)檔案管理部門反映，通過行政的辦法獲得解決。