建設(shè)工程施工合同糾紛的處理方式分別是有約定按約定；沒有約定的協(xié)議優(yōu)先；協(xié)商不成的可以申請調(diào)解；調(diào)解不成的可以向法院起訴；當事人有簽訂仲裁協(xié)議或仲裁條款的，可以申請仲裁機構(gòu)進行仲裁。行為人也可以不經(jīng)過調(diào)解，直接訴訟或仲裁。

一、和解或調(diào)解 1、建設(shè)工程承包合同爭議時，當事人可以自行協(xié)商和解，或者通過第三者進行調(diào)解。 2、和解是指當事人通過自行友好協(xié)商，解決合同發(fā)生的爭議。調(diào)解是由當事人以外的調(diào)解組織或者個人主持，在查明事實和分清是非的基礎(chǔ)上，通過說服引導(dǎo)，促進當事人互諒互讓，友好地解決爭議。 3通過和解或調(diào)解解決爭議，可以節(jié)省時間，節(jié)省仲裁或者訴訟費用，有利于日后的繼續(xù)交往和合作，是當事人解決合同爭議的首選方式。但這種調(diào)解不具有法律效力，提起調(diào)解要靠當事人具有誠意，達成和解后要靠當事人自覺地履行。和解和調(diào)解是在當事人自愿的原則下進行的，一方當事人不能強迫對方當事人接受自己的意志，第三方也不能強迫調(diào)解。 二、仲裁 1、建設(shè)工程承包合同當事人如果不愿意和解、調(diào)解，或者和解、調(diào)解不成功，可以根據(jù)達成的仲裁協(xié)議，將合同爭議提交仲裁機構(gòu)仲裁。 2、仲裁具有辦案迅速、程序簡便的特點和優(yōu)點，而且進入仲裁程序以后，仍然采取仲裁與調(diào)解相結(jié)合的方法，先調(diào)解，后仲裁，首先著力于以調(diào)解方式解決。經(jīng)調(diào)解成功達成協(xié)議后，仲裁庭即制作調(diào)解書或者根據(jù)協(xié)議的結(jié)果制作裁決書，調(diào)解書和裁決書都具有法律效力。 3、提請仲裁的前提是合同雙方當事人已經(jīng)訂立了仲裁協(xié)議，沒有訂立仲裁協(xié)議，不能申請仲裁。仲裁協(xié)議包括合同訂立的仲裁條款或者附屬于合同的協(xié)議。合同中的仲裁條款或者附屬于合同的協(xié)議，被視為與其他條款相分離而獨立存在的一部分，合同的變更、解除、終止、失效或者被確認無效，均不影響仲裁條款或者仲裁協(xié)議的效力。國內(nèi)合同當事人可以在仲裁協(xié)議中約定在發(fā)生爭議后到國內(nèi)的任何一家仲裁機構(gòu)仲裁，對仲裁機構(gòu)的選定沒有級別管轄和地域管轄限制。 三、訴訟 1、如果建設(shè)工程承包合同當事人沒有在合同中訂立仲裁條款，發(fā)生爭議后也沒有達成書面的仲裁協(xié)議，或者達成的仲裁協(xié)議無效，合同的任何一方當事人，包括涉外合同的當事人，都可向人民法院提起訴訟。在人民法院提起合同案訴訟，應(yīng)依照《民事訴訟法》的規(guī)定進行。 2、經(jīng)過訴訟程序或者仲裁程序產(chǎn)生的具有法律效力的判決、仲裁裁決或調(diào)解書，當事人應(yīng)當履行。如果負有履行義務(wù)的當事人不履行判決、仲裁裁決或調(diào)解書，對方當事人可以請求人民法院予以執(zhí)行。執(zhí)行也就是強制執(zhí)行，即由人民法院采取強迫措施，促進義務(wù)人履行法律文書確定的義務(wù)。 3、合同當事人在遇到合同爭議時，究竟是通過協(xié)商，還是通過調(diào)解、仲裁、訴訟去解決，應(yīng)當認真考慮對方當事人的態(tài)度、雙方之間的合作關(guān)系、自身的財力和人力等實際情況，權(quán)衡出對自己最為有利的爭議解決對策。