農村自建房申請土地使用證的流程如下： 1、準備身份證件、戶口本復印件等相關材料，； 2、到所屬鄉(xiāng)鎮(zhèn)國土資源管理所申請辦理土地使用證，主要指的是宅基地使用權證； 3、填寫宅基地申請表，并提交相關材料； 4、審查材料，審查通過后在規(guī)定期限內發(fā)證。 根據《土地管理法》第六十二條第一款規(guī)定，農村村民一戶只能擁有一處宅基地，其宅基地的面積不得超過省、自治區(qū)、直轄市規(guī)定的標準。 第六十二條第四款規(guī)定，農村村民住宅用地，由鄉(xiāng)（鎮(zhèn)）人民政府審核批準；其中，涉及占用農用地的，依照本法第四十四條的規(guī)定辦理審批手續(xù)。

土地使用證內各項數據和編號，如單位名稱、四至、土地數量、位置、土地變更等，必須與土地登記表相一致。土地使用證附圖可根據土地利用現(xiàn)狀底圖或地籍圖透繪獲得。隨著面積和界線的變更，附圖也應作相應改動。 國有土地使用證由國家土地管理局統(tǒng)一監(jiān)制，市、縣人民政府頒發(fā)，土地管理機關填寫，發(fā)給依法使用國有土地的單位和個人，并由其保存。其主要內容包括： ①土地使用者名稱、地址、圖號、地號、用途、批準使用期限、四至、填發(fā)機關簽章、年、月、日。 ②城鎮(zhèn)土地使用中用地面積，其中建筑占地，共有使用權面積，其中分攤面積，土地等級農村土地中土地總面積，其中地類面積。 ④變更記事。 ⑤附圖以及證書的編號等。 辦理土地使用證需提供資料： （一）房改房 1．土地登記申請表。1份（申請人在窗口領取填寫并加蓋私章） 2．公有住房出售價格審批。（復印件1份） 3．房屋所有權證。（復印件1份，其中分層分戶平面圖2份） 4．申請人個人身份證。（復印件1份） 5．換購房登記的需提交原土地使用權證原件。 6．屬共有產的需提交房屋共有人產權證。（復印件1份） （二）商品房、拆遷安置房、私房轉讓 1．土地登記申請表。1份（申請人在窗口領取填寫并加蓋私章） 2．購房合同書或拆遷協(xié)議書。（復印件1份，其中拆遷前已領取土地證的須交回原證） 3．房屋所有權證（屬共有產的需提供房屋共有人產權證）。（復印件1份） 4．契證。（復印件1份） 5．申請人身份證。（復印件1份） 6．產權人為單位的，須提供企業(yè)法人營業(yè)執(zhí)照或機構代碼證復印件，法人代表身份證。（申請人在窗口領取填寫并加蓋公章）