除財政部、國家稅務(wù)總局特殊規(guī)定外，簡易征收項目(含“營改增”簡易征收項目)可開具增值稅專用發(fā)票。自開票納稅人可自行開具增值稅專用發(fā)票，小規(guī)模納稅人可向主管稅務(wù)機關(guān)申請代開增值稅專用發(fā)票。只要你將成本中用于簡易項目和適用稅率分開核算，適用稅率部分的成本取得專用發(fā)票認證通過后均可以抵扣。比如，建筑業(yè)的新老項目，還有增值稅條例下的適用簡易征收的貨物等等都是分開核算就可以。會計上嚴格按照財會〔2016〕22號新規(guī)即可。同時也需要注意，有部分項目不得抵扣!!目前財政部、國家稅務(wù)總局特殊規(guī)定不得開具增值稅專用發(fā)票的簡易征收項目 1、一般納稅人銷售自己使用過的固定資產(chǎn)，凡根據(jù)財稅〔2008〕170號和財稅〔2009〕9號、財稅【2014】57號等文件規(guī)定，適用按簡易辦法依3%征收率減按2%征收增值稅政策的，應(yīng)開具普通發(fā)票，不得開具增值稅專用發(fā)票。附注：根據(jù)國家稅務(wù)總局公告2015年第90號文件規(guī)定，納稅人銷售自己使用過的固定資產(chǎn)，適用簡易辦法依照3%征收率減按2%征收增值稅政策的，可以放棄減稅，按照簡易辦法依照3%征收率繳納增值稅，并可以開具增值稅專用發(fā)票。 2、小規(guī)模納稅人銷售自己使用過的固定資產(chǎn)，應(yīng)開具普通發(fā)票，不得由稅務(wù)機關(guān)代開增值稅專用發(fā)票。 3、納稅人銷售舊貨，應(yīng)開具普通發(fā)票，不得自行開具或者由稅務(wù)機關(guān)代開增值稅專用發(fā)票。 4、一般納稅人的單采血漿站銷售非臨床用人體血液，可以按照簡易辦法依照3%征收率計算應(yīng)納稅額，但不得對外開具增值稅專用發(fā)票(國稅函〔2009〕456號)。

《中華人民共和國稅收征收管理法》 第六十一條扣繳義務(wù)人未按照規(guī)定設(shè)置、保管代扣代繳、代收代繳稅款帳簿或者保管代扣代繳、代收代繳稅款記帳憑證及有關(guān)資料的，由稅務(wù)機關(guān)責令限期改正，可以處二千元以下的罰款;情節(jié)嚴重的，處二千元以上五千元以下的罰款。