根據(jù)《中華人民共和國公司登記管理條例》第四十九條規(guī)定，分公司被公司撤銷、依法責(zé)令關(guān)閉、吊銷營業(yè)執(zhí)照的，公司應(yīng)當(dāng)自決定作出之日起30日內(nèi)向該分公司的公司登記機(jī)關(guān)申請注銷登記。申請注銷登記應(yīng)當(dāng)提交公司法定代表人簽署的注銷登記申請書和分公司的《營業(yè)執(zhí)照》。公司登記機(jī)關(guān)準(zhǔn)予注銷登記后，應(yīng)當(dāng)收繳分公司的《營業(yè)執(zhí)照》。 第五十九條第三款規(guī)定，公司登記機(jī)關(guān)依法作出變更登記、注銷登記、撤銷變更登記決定，公司拒不繳回或者無法繳回營業(yè)執(zhí)照的，由公司登記機(jī)關(guān)公告營業(yè)執(zhí)照作廢。

總公司撤銷分公司程序如下： (一)注銷(分)公司國、地稅登記證注銷(分)公司國稅、地稅登記證所需資料： 1、國地稅正副本; 2、本年度匯算清繳報告; 3、注銷報告; 4、填寫稅務(wù)注銷表格(如果有未用完發(fā)票要先核銷)。 (二)到公司主管工商局辦理公司注銷備案所需資料： 1、公司營業(yè)執(zhí)照復(fù)印件; 2、公司股東會決議(內(nèi)容就是注銷公司，成立清算小組); 3、公司原始檔案; 4、到工商局領(lǐng)取表格;注銷(分)公司國、地稅登記證和到公司主管工商局辦理公司注銷備案可以同時辦理。 (三)登報公告所需資料： 1、公司營業(yè)執(zhí)照復(fù)印件、公司股東會決議復(fù)印件; 2、法定代表人身份證復(fù)印件; 3、公告內(nèi)容。 (四)登報45日后，再次到工商局辦理注銷申請所需資料： 1、公司營業(yè)執(zhí)照原件(正副本); 2、稅務(wù)注銷證明文件; 3、公司股東會決議; 4、公司清算報告; 5、工商局領(lǐng)取的表格; 6、公司原始檔案。 (五)到質(zhì)監(jiān)局注銷代碼證所需資料： 1、營業(yè)執(zhí)照注銷證明文件; 2、代碼證原件(正副本)。