首先，從廣義層面來看，工程墊資是否合法分為政府投資項目和非政府投資項目。建設(shè)部、國家計委、財政部于1996年發(fā)布了《關(guān)于嚴格禁止工程建設(shè)帶資承包的通知》，明確禁止工程墊資施工。2006年1月4日，建設(shè)部、國家發(fā)改委、財政部、中國人民銀行發(fā)布《關(guān)于禁止政府投資項目以帶資承包方式建設(shè)的通知》，廢止了原建設(shè)部、國家計委、財政部發(fā)布的《關(guān)于嚴格禁止工程建設(shè)帶資承包的通知》，明確規(guī)定政府投資項目不得以建筑企業(yè)帶資承包方式建設(shè)，不得以建筑企業(yè)帶資承包為招標條件，禁止墊資承包的項目范圍限制在政府投資項目，這意味著非政府項目建設(shè)單位和建設(shè)單位可以約定墊資承包。因此，廣義而言，政府投資項目的預(yù)付款是非法的，非政府項目的預(yù)付款因未明確禁止而合法。狹義上來說，無論是政府投資項目還是非政府投資項目，我國法律都不禁止工程預(yù)付款。在私法領(lǐng)域，法律不禁止就是自由，最高人民法院頒布的司法解釋明確規(guī)定，雙方可以在合同中約定預(yù)付款承包，因此工程預(yù)付款是合法的。

《最高人民法院關(guān)于審理建設(shè)工程施工合同糾紛案件適用法律問題的解釋（一）》第二十五條 當事人對墊資和墊資利息有約定，承包人請求按照約定返還墊資及其利息的，人民法院應(yīng)予支持，但是約定的利息計算標準高于墊資時的同類貸款利率或者同期貸款市場報價利率的部分除外。 當事人對墊資沒有約定的，按照工程欠款處理。 當事人對墊資利息沒有約定，承包人請求支付利息的，人民法院不予支持。