(一)概念區(qū)別 商業(yè)秘密是企業(yè)的財(cái)產(chǎn)權(quán)利，它關(guān)乎企業(yè)的競(jìng)爭(zhēng)力，對(duì)企業(yè)的發(fā)展至關(guān)重要，有的甚至直接影響到企業(yè)的生存。商業(yè)秘密等知識(shí)產(chǎn)權(quán)可申請(qǐng)緊急保全。 專(zhuān)利一般是由政府機(jī)關(guān)或者代表若干國(guó)家的區(qū)域性組織根據(jù)申請(qǐng)而頒發(fā)的一種文件，這種文件記載了發(fā)明創(chuàng)造的內(nèi)容，并且在一定時(shí)期內(nèi)產(chǎn)生這樣一種法律狀態(tài)，即獲得專(zhuān)利的發(fā)明創(chuàng)造在一般情況下他人只有經(jīng)專(zhuān)利權(quán)人許可才能予以實(shí)施。在我國(guó)，專(zhuān)利分為發(fā)明、實(shí)用新型和外觀設(shè)計(jì)三種類(lèi)型。 (二)保護(hù)制度設(shè)立目的不同 商業(yè)秘密是秘不示人的秘密武器，通過(guò)《反不正當(dāng)競(jìng)爭(zhēng)法》保護(hù)，目的側(cè)重于維護(hù)公平競(jìng)爭(zhēng)。 專(zhuān)利是國(guó)家授予的一項(xiàng)合法壟斷權(quán)，通過(guò)《專(zhuān)利法》保護(hù)，目的側(cè)重于鼓勵(lì)創(chuàng)新。 (三)保護(hù)范圍不同 從對(duì)兩者的概念分析可以看到，商業(yè)秘密所涵蓋的保護(hù)范圍較為廣泛，包括技術(shù)信息及經(jīng)營(yíng)信息。只要當(dāng)信息不能被歸為“發(fā)明、實(shí)用新型和外觀設(shè)計(jì)”時(shí)均可以作為商業(yè)秘密保護(hù)，包括但不限于設(shè)計(jì)方案、可獲得專(zhuān)利權(quán)的裝置或工藝手法，甚至可以是研發(fā)過(guò)程中的試驗(yàn)記錄或是任何將來(lái)具有價(jià)值的其他信息。 專(zhuān)利的保護(hù)范圍具有一定的局限性，至少有一部分信息是需要公開(kāi)的，比如說(shuō)明書(shū)、附圖、具體實(shí)施方式等。 (四)取得方式及成本不同 專(zhuān)利權(quán)基于申請(qǐng)的并經(jīng)過(guò)行政機(jī)關(guān)公告授權(quán)取得，授予專(zhuān)利權(quán)的發(fā)明和實(shí)用新型應(yīng)當(dāng)具備新穎性、創(chuàng)造性和實(shí)用性并應(yīng)當(dāng)在授予專(zhuān)利權(quán)后向社會(huì)公開(kāi)。發(fā)明專(zhuān)利的期限為二十年，實(shí)用新型和外觀設(shè)計(jì)的期限為十年(外觀設(shè)計(jì)有望改為15年)，期滿需要繳費(fèi)來(lái)續(xù)期。 商業(yè)秘密的取得無(wú)需行政機(jī)關(guān)審批，只要該信息符合秘密性、保密性和價(jià)值性即可(特別說(shuō)明，新穎性不是商業(yè)秘密的構(gòu)成要件，新穎性是專(zhuān)利制度中的法律概念和專(zhuān)利有權(quán)需要符合的條件之一，并不能套用到商業(yè)秘密制度上。)，核心技術(shù)信息所有人自行采取保密措施。此外，商業(yè)秘密沒(méi)有期限限制，只要擁有者一直持續(xù)把某信息當(dāng)商業(yè)秘密對(duì)待，該信息從產(chǎn)生之日起立即生效，而且可以一直持續(xù)擁有商業(yè)秘密的身份，而無(wú)需去向任何機(jī)構(gòu)申請(qǐng)登記也無(wú)需繳納任何費(fèi)用。但看似無(wú)須官方成本，而根據(jù)“免費(fèi)的才是最貴的”理論，企業(yè)通常為了維護(hù)商業(yè)秘密需要采取一系列保密措施，這些措施的花費(fèi)可能是上無(wú)封頂?shù)摹?(五)公開(kāi)后果不同 專(zhuān)利的取得是以公開(kāi)為前提，是通過(guò)公開(kāi)后取得權(quán)利保護(hù)。而商業(yè)秘密一旦公開(kāi)，就不再受到保護(hù)了。 (六)侵權(quán)判定原則不同 專(zhuān)利侵權(quán)通過(guò)判斷被控侵權(quán)技術(shù)方案是否落入專(zhuān)利權(quán)保護(hù)范圍來(lái)認(rèn)定，主要是運(yùn)用相同侵權(quán)或等同侵權(quán)等原則，被訴侵權(quán)技術(shù)方案的技術(shù)特征與權(quán)利要求記載的全部技術(shù)特征相比，缺少權(quán)利要求記載的一個(gè)以上的技術(shù)特征，或者有一個(gè)以上技術(shù)特征不相同也不等同的，人民法院應(yīng)當(dāng)認(rèn)定其沒(méi)有落入專(zhuān)利權(quán)的保護(hù)范圍。 商業(yè)秘密侵權(quán)判定的原則主要是相同或者實(shí)質(zhì)相似+接觸-合法來(lái)源，與專(zhuān)利侵權(quán)判定不同的是需要判斷被控侵權(quán)人是否實(shí)際或可能接觸過(guò)權(quán)利人的商業(yè)秘密。