醫(yī)療事故糾紛鑒定的啟動程序，有三種方式，包括：醫(yī)患雙方共同委托鑒定、衛(wèi)生行政部門組織鑒定和法院指定鑒定。一、醫(yī)患雙方共同委托做醫(yī)院醫(yī)療事故鑒定。如果醫(yī)患雙方在治療過程中，發(fā)生醫(yī)療糾紛的，并且協(xié)商一致，通過醫(yī)療事故鑒定，來確定是否構(gòu)成醫(yī)療事故、構(gòu)成何種等級的醫(yī)療事故、醫(yī)療事故賠償數(shù)額的。通過醫(yī)療事故鑒定來解決醫(yī)療糾紛的，可以由醫(yī)療糾紛雙方當事人共同委托當?shù)蒯t(yī)學(xué)會組織醫(yī)療事故鑒定。按照《醫(yī)療事故處理條例》規(guī)定，醫(yī)療事故鑒定的組織，是由醫(yī)療糾紛發(fā)生地的衛(wèi)生行政部門主管。衛(wèi)生行政部門下屬的醫(yī)學(xué)會，專門設(shè)有醫(yī)學(xué)會，該委員會是負責醫(yī)療事故技術(shù)鑒定工作的。二、衛(wèi)生行政部門組織鑒定的。如果當?shù)氐男l(wèi)生行政部門，接到醫(yī)療機構(gòu)關(guān)于重大醫(yī)療過失行為的報告，或者醫(yī)療事故爭議當事人，要求處理醫(yī)療事故爭議的申請后，衛(wèi)生行政部門認為需要進行醫(yī)療事故技術(shù)鑒定的，應(yīng)當交由負責醫(yī)療事故技術(shù)鑒定工作的醫(yī)學(xué)會組織鑒定。當?shù)匦l(wèi)生行政部門啟動醫(yī)療事故鑒定的程序醫(yī)療衛(wèi)生行政主管部門接到下屬的醫(yī)療機構(gòu)的報告組織的鑒定；或者是患者及其家屬單方面要求衛(wèi)生行政主管部門組織醫(yī)療事故鑒定，并且得到許可的情況下方可以啟動。三、法院要求鑒定的。根據(jù)中國訴訟法的相關(guān)規(guī)定，如果在醫(yī)療糾紛訴訟中，醫(yī)療機構(gòu)和患者及其家屬都沒有提出醫(yī)療事故鑒定申請的，而主審法官認為有必要做事故糾紛的，那么法官自己也可以提出醫(yī)療事故鑒定的要求，啟動醫(yī)療事故鑒定程序。