1、法律界定的范圍不同。政府采購(gòu)是涵蓋使用財(cái)政性資金的所有政府采購(gòu)活動(dòng)，包括貨物、服務(wù)和工程。其中服務(wù)項(xiàng)目的采購(gòu)屬政府采購(gòu)獨(dú)有，如會(huì)議定點(diǎn)、加油、修車、保險(xiǎn)、印刷等。招投標(biāo)使用的是資金性質(zhì)不同，其范圍只有建設(shè)工程和相關(guān)貨物，不包含服務(wù)。 2、實(shí)施的主體不同。遵照《政府采購(gòu)法》的規(guī)定，政府依法在每一個(gè)行政區(qū)劃單位成立一個(gè)政府采購(gòu)中心管理政府內(nèi)部的采購(gòu)事務(wù)，是一個(gè)純服務(wù)性機(jī)構(gòu)，承擔(dān)實(shí)施本級(jí)《政府采購(gòu)集中采購(gòu)目錄》內(nèi)的項(xiàng)目采購(gòu)行政職能，其經(jīng)費(fèi)列入財(cái)政預(yù)算，人員參照公務(wù)員管理。與招投標(biāo)機(jī)構(gòu)在性質(zhì)上完全不同。根據(jù)政府采購(gòu)的特殊性，各省從實(shí)行政府采購(gòu)制度一開始，就設(shè)立獨(dú)立的采購(gòu)中心。對(duì)招投標(biāo)而言，國(guó)家有關(guān)部門批準(zhǔn)登記設(shè)立的各類建設(shè)工程招投標(biāo)機(jī)構(gòu)，其性質(zhì)屬于營(yíng)利性企業(yè)，不是政府的內(nèi)設(shè)機(jī)構(gòu)，沒有行政職能。 3、組織形式有區(qū)別。政府采購(gòu)是由財(cái)政部門、政府采購(gòu)中心、采購(gòu)人、評(píng)標(biāo)專家、供應(yīng)商、監(jiān)察、審計(jì)機(jī)關(guān)六方共同組織采購(gòu)工作，實(shí)行“采”“管”分離，并接受紀(jì)檢部門的全程監(jiān)督，在程序、方式、人員等方面具有很強(qiáng)的規(guī)范性，從而更有利于實(shí)現(xiàn)“三公”原則和避免暗箱操作。而招投標(biāo)是由業(yè)主單位加招標(biāo)機(jī)構(gòu)和投標(biāo)企業(yè)有時(shí)甚至是兩方組織完成采購(gòu)活動(dòng)。 4、資金保障不同。政府采購(gòu)實(shí)行嚴(yán)格的預(yù)算管理，并有堅(jiān)實(shí)的政府采購(gòu)資金作采購(gòu)項(xiàng)目的保障，由國(guó)庫(kù)統(tǒng)一集中支付，減少了撥款環(huán)節(jié)，避免了資金流失占用和拖欠資金等弊端，維護(hù)了政府形象。而招投標(biāo)不具有上述特點(diǎn)。 5、服務(wù)結(jié)果不同。政府采購(gòu)中心作為政府內(nèi)部的服務(wù)機(jī)構(gòu)不收取任何費(fèi)用，全部免費(fèi)服務(wù)，同時(shí)對(duì)政府采購(gòu)資金的節(jié)余部分全部歸財(cái)政，充分體現(xiàn)了反腐倡廉目的，這是招投標(biāo)企業(yè)所無法做到的。

政府采購(gòu)是實(shí)行財(cái)政統(tǒng)一管理，監(jiān)察、審計(jì)和行政主管部門分工監(jiān)督的體制。最高領(lǐng)導(dǎo)機(jī)關(guān)是財(cái)政部。工程招標(biāo)投標(biāo)是實(shí)行發(fā)改協(xié)調(diào)指導(dǎo)，各行業(yè)主管部門歸口監(jiān)督的體制，最高領(lǐng)導(dǎo)機(jī)關(guān)是發(fā)改委。