根據(jù)“民事證據(jù)規(guī)定”第四條第（八）項(xiàng)的規(guī)定，醫(yī)療機(jī)構(gòu)在醫(yī)療糾紛中應(yīng)承擔(dān)的舉證責(zé)任包括： 1、醫(yī)療行為與損害后果之間不存在因果關(guān)系在醫(yī)療侵權(quán)糾紛中，當(dāng)患者提供證據(jù)證明存在損害后果后，醫(yī)療機(jī)構(gòu)的醫(yī)療行為與損害后果之間是否存在因果關(guān)系，往往是醫(yī)患雙方爭(zhēng)議的焦點(diǎn)之一，也是醫(yī)療機(jī)構(gòu)承擔(dān)舉證責(zé)任的關(guān)鍵內(nèi)容之一。而對(duì)這一舉證責(zé)任的完成，醫(yī)療機(jī)構(gòu)往往通過(guò)申請(qǐng)醫(yī)療事故鑒定來(lái)進(jìn)行。 醫(yī)療機(jī)構(gòu)都認(rèn)為，只要申請(qǐng)了醫(yī)療事故鑒定，提交了醫(yī)療行為不構(gòu)成醫(yī)療事故的《醫(yī)療事故鑒定書(shū)》，自己的舉證責(zé)任就算完成了。而患方則認(rèn)為，醫(yī)療機(jī)構(gòu)僅證明醫(yī)療行為不構(gòu)成醫(yī)療事故還沒(méi)有完成其舉證責(zé)任。因?yàn)椤懊袷伦C據(jù)規(guī)定”第四條第（八）項(xiàng)規(guī)定的“醫(yī)療過(guò)錯(cuò)”不僅包括醫(yī)療過(guò)失，也包括醫(yī)療故意，主要是間接故意。 而且根據(jù)《醫(yī)療事故處理條例》（以下簡(jiǎn)稱(chēng)“醫(yī)療條例”）第二條規(guī)定，醫(yī)療事故的定義為：違反醫(yī)療衛(wèi)生管理法律、行政法規(guī)、部門(mén)規(guī)章和診療護(hù)理規(guī)范、常規(guī)，過(guò)失造成患者人身?yè)p害的事故。這就是說(shuō)，醫(yī)療事故是以過(guò)失為過(guò)錯(cuò)條件的，不包括故意，而“民事證據(jù)規(guī)定”要求醫(yī)療機(jī)構(gòu)承擔(dān)的舉證責(zé)任還包括故意，因而醫(yī)療機(jī)構(gòu)還應(yīng)當(dāng)就其醫(yī)療行為不存在故意（一般為間接故意）損害患者人身的事實(shí)承擔(dān)舉證責(zé)任。 這就要求醫(yī)療機(jī)構(gòu)不僅要提交醫(yī)療事故鑒定結(jié)論，還要提交不存在醫(yī)療過(guò)錯(cuò)（包括間接故意）的司法鑒定結(jié)論。醫(yī)療機(jī)構(gòu)僅僅提交醫(yī)療事故鑒定結(jié)論并沒(méi)有完成其舉證責(zé)任。 醫(yī)務(wù)人員可能不存在直接故意傷害患者的動(dòng)機(jī)和行為，但卻可能出于其他目的，有怠于積極救治傷病員放任危害患者的后果發(fā)生的行為，并因此給患者造成人身?yè)p害的后果。對(duì)此，醫(yī)療機(jī)構(gòu)還應(yīng)就其沒(méi)有因其他原因而放任危害患者人身的事實(shí)存在承擔(dān)舉證責(zé)任，這就要求其進(jìn)行醫(yī)療過(guò)錯(cuò)鑒定。 這是醫(yī)療機(jī)構(gòu)的法定義務(wù)，不能履行這一義務(wù)，醫(yī)療機(jī)構(gòu)就應(yīng)當(dāng)承擔(dān)舉證不能的責(zé)任，承擔(dān)對(duì)其不利的后果，醫(yī)療機(jī)構(gòu)別無(wú)選擇。當(dāng)然醫(yī)療機(jī)構(gòu)可以選擇只進(jìn)行醫(yī)療過(guò)錯(cuò)的鑒定，而省去醫(yī)療事故的鑒定所帶來(lái)的不必要的麻煩和資源浪費(fèi)。 但是，如果醫(yī)療機(jī)構(gòu)想利用當(dāng)前法律適用二元化的弊端，達(dá)到其盡可能少賠償?shù)哪康模捅仨毶暾?qǐng)進(jìn)行兩個(gè)鑒定，先鑒定不存在醫(yī)療過(guò)錯(cuò)中的間接故意，在確定存在醫(yī)療過(guò)失后，再鑒定其過(guò)失在醫(yī)療事故中的作用大小、責(zé)任程度、應(yīng)承擔(dān)的責(zé)任份額；或者先進(jìn)行醫(yī)療事故鑒定，在確定不構(gòu)成醫(yī)療事故鑒定后再進(jìn)行醫(yī)療過(guò)錯(cuò)鑒定。 此外，如患方要求追究醫(yī)務(wù)人員醫(yī)療事故犯罪刑事責(zé)任的話，也必須在排除間接故意犯罪的基礎(chǔ)上，申請(qǐng)醫(yī)療事故鑒定，并以此為依據(jù)追究相關(guān)人員的醫(yī)療事故犯罪的刑事責(zé)任。