對于新型農村合作醫(yī)大病報銷，其報銷比例根據(jù)不同醫(yī)院等級，其報銷比例會有所不同。除了發(fā)生超過基本醫(yī)療統(tǒng)籌基金最高支付限額以上的醫(yī)療費用，按照不同范圍的醫(yī)療費用，其報銷比例會有所不同。一般醫(yī)療費用花費在0—4萬元以下的可以報銷85%；醫(yī)療費用在4萬—8萬元以下的可以報銷90%；醫(yī)療費用在8萬元以上的可以報銷95%，并且在每一個醫(yī)療年度內，最高支付的限額為15萬元。其中，在不同醫(yī)療機構其報銷比例分別為：1、門診統(tǒng)籌鄉(xiāng)、村補助比例分別提高到了65%、75%。2、在一級醫(yī)療機構住院費用在400元以下者，是不設有起付線標準的。在二級醫(yī)療機構補助的比例將會提高到75%—80%；在三級醫(yī)院機構住院費用補助的比例可以提高到55%—60%；在省三級醫(yī)療機構住院費用，所補助的比例會提高到55%。3、兒童先天性心臟病、兒童白血病、兒童苯丙酮尿癥等8種大病，新農合的補助病種定額的比例為70%；肺癌、食道癌、宮頸癌等12中大病，新農合的補助病種定額的比例將會達到70%。

(一)城鎮(zhèn)職工(15種) 1、直接審批病種(5種)：惡性腫瘤門診放化療、慢性腎功能衰竭腹膜透析(血液透析)、器官移植術后服用抗排斥藥、白血病、肝硬化(失代償期)。 2、需鑒定病種(10種)：糖尿病、原發(fā)性高血壓病、多耐藥肺結核、精神分裂癥、冠狀動脈硬化性心臟病、慢性再生障礙性貧血、腦梗塞后遺癥、腦出血后遺癥、慢性活動性肝炎、系統(tǒng)性紅斑狼瘡。 (二)城鎮(zhèn)居民(27種) 1、成人直接審批病種(5種)：惡性腫瘤門診放化療、慢性腎功能衰竭腹膜透析(血液透析)、器官移植術后服用抗排斥藥、白血病、肝硬化(失代償期)。 2、成人需鑒定病種(12種)：糖尿病、原發(fā)性高血壓病、多耐藥肺結核、精神分裂癥、冠狀動脈硬化性心臟病、慢性再生障礙性貧血、腦梗塞后遺癥、腦出血后遺癥、慢性活動性肝炎、系統(tǒng)性紅斑狼瘡、血友病、慢性丙型肝炎。 3、學生兒童需鑒定病種(10種)：小兒腦性癱瘓、心肌炎、營養(yǎng)性貧血、過敏性紫癜、泌尿系感染、急性腎小球腎炎、嬰幼兒哮喘、血小板減少性紫癜、支氣管肺炎、支氣管炎。(此類人群當日鑒定通過，次日享受) (三)新農合(26種) 尿毒癥三期腎透析、血友病、白血病、各類器官移植后治療、先心病術后兩年內、肝硬化(失代償期)、支架術后兩年內的心臟病、再生障礙性貧血、系統(tǒng)性紅斑狼瘡、腎病綜合癥、血小板減少性紫癜、重性精神性疾病、慢性心臟病心衰、慢性阻塞性肺病、強直性脊柱炎、帕金森綜合癥、惡性腫瘤恢復期三年內、結締組織病、糖尿病伴并發(fā)癥(2種含2種以上并發(fā)癥)、高血壓三級、腦血管疾病康復期、(類)風濕性關節(jié)炎伴功能性障礙、癲癇、慢型克山病、中(重)度氟骨癥、大骨節(jié)病。