勞動合同書是畢業(yè)離校后到單位正式報到后簽訂，就業(yè)協(xié)議書是在校期間簽訂；勞動合同書的主體是勞動者和用人單位，就業(yè)協(xié)議書的主體是學校、畢業(yè)生和用人單位；勞動合同書主要適用勞動法、勞動合同法，就業(yè)協(xié)議書主要適用普通高等學校畢業(yè)生就業(yè)工作暫行規(guī)定、民法典。

1,主體不同。就業(yè)協(xié)議適用于應屆畢業(yè)生與用人單位、學校三方之間，學校是就業(yè)協(xié)議的簽訂方或簽約方，就業(yè)協(xié)議對用人單位的性質(zhì)沒有規(guī)定，適用任何單位；而勞動合同只適用于勞動者與用人單位之間，與學校無關。 2,內(nèi)容不同。畢業(yè)生就業(yè)協(xié)議的內(nèi)容主要是畢業(yè)生如實介紹自身情況，并表示愿意到用人單位就業(yè)、用人單位表示愿意接受畢業(yè)生，學校同意推薦畢業(yè)生并列入就業(yè)方案，而不涉及畢業(yè)生到用人單位報到后，原享有的權(quán)利義務。勞動合同的內(nèi)容涉及勞動報酬、勞動保護、工作內(nèi)容、勞動紀律等方方面面，勞動權(quán)利義務更為明確。 3,簽訂時間不同。一般來說就業(yè)協(xié)議應在畢業(yè)生就業(yè)之前簽訂，而勞動合同往往在畢業(yè)生到用人單位報到后才簽訂。 4,目的不同。就業(yè)協(xié)議是畢業(yè)生和用人單位關于將來就業(yè)意向的初步約定，是對雙方的基本條件以及即將簽訂的勞動合同的基本內(nèi)容的大體認可，并經(jīng)用人單位的上級主管部門（如有）和高校就業(yè)部門同意，一經(jīng)畢業(yè)生、用人單位、高校、用人單位主管部門簽字蓋章。