1、使用的法律、法規(guī)不同勞動合同適用《勞動法》、《勞動合同法》及勞動人事部門頒布的有關勞動人事方面的規(guī)章。而就業(yè)協(xié)議目前無法可依，只能使用教育部頒發(fā)的《普通高等學校畢業(yè)生就業(yè)工作暫行規(guī)定》和有關政策。 2、適用主體不同勞動合同是勞動者與用人單位之間確立勞動關系的協(xié)議，只要雙方當事人協(xié)商一致，符合國家的法律、行政法規(guī)，無欺詐、脅迫等手段．經(jīng)雙方簽字蓋章，合同即生效。而目前的就業(yè)協(xié)議陳畢業(yè)生與用人單位雙方簽字、蓋章外，尚需學校介入。盡管學校不是主體一方，不作為協(xié)議的一方簽字，但學校作為簽證登記方，必須在協(xié)議書上蓋章，沒有經(jīng)過學校鑒證登記的協(xié)議，不列入學生就業(yè)方案。學校畢業(yè)生就業(yè)工作部門對就業(yè)協(xié)議進行監(jiān)證，旨在保護學生與用人單位的利益，維護協(xié)議的嚴肅性、確保協(xié)議的有效性。就業(yè)協(xié)議書上除了畢業(yè)生、用人單位、學校三方簽字蓋章外，還必須有元人事權的用人單位上級主管部門的簽字蓋章。 3、適用的人員不同勞動合同可以適用于各類人員，凡是中華人民共和國的公民，只要有勞動能力并符合法律規(guī)定的條件，經(jīng)過供需見面、雙向選擇，一經(jīng)錄用都可以與用人單位簽訂勞動合同。而就業(yè)協(xié)議適用的人群只限于高校畢業(yè)生、畢業(yè)研究生。 4、簽訂的內(nèi)容不同依據(jù)《勞動法》的規(guī)定，勞動合同的內(nèi)容包括7項必備條款(前面已經(jīng)詳細講述)，除此之外，當事人可以協(xié)商約定其他內(nèi)容，條款十分齊全。相比之下，就業(yè)協(xié)議的條款就比較簡單，主要是畢業(yè)生如實向用人單位介紹自己情況，愿意在規(guī)定期限內(nèi)到用人單位報到并服從用人單位安排；用人單位如實向畢業(yè)生介紹本單位情況，同意錄用該畢業(yè)生等。 5、簽訂時間不同一般就業(yè)協(xié)議簽訂在前，是高校前畢業(yè)生在找工作過程中，落實用人單位后簽訂的；勞動合同簽訂在后，是畢業(yè)生到用人單位報到后簽訂的。畢業(yè)生雙向選擇成功后，由雙方簽訂就業(yè)協(xié)議，并經(jīng)學校登記、確認，畢業(yè)后憑學校報到證到簽訂就業(yè)協(xié)議的用人單位正式報到。學生到用人單位報到后，雙方按有關法律、法規(guī)規(guī)定及就業(yè)協(xié)議約定條款訂立勞動合同，并辦理有關錄用手續(xù)。勞動合同訂立后，就業(yè)協(xié)議就自動終止了。當然，這也不是說原來的協(xié)議條款就不管用了。就業(yè)協(xié)議中的有關條款，包括合同期、服務期、試用期和福利待遇等符合勞動法的內(nèi)容．應當作為簽訂勞動合同的依據(jù)。