依據(jù)《最高人民法院關于民事訴訟證據(jù)的若干規(guī)定》和《民事訴訟法》的規(guī)定，醫(yī)療損害責任糾紛舉證責任應如下分配： （一）受害人（患者或其法定代理人）的舉證責任在醫(yī)療行為引起的侵權訴訟中，受害人應當就自己受損害的事實和接受過醫(yī)療的事實承擔舉證責任。損害包括病員生命和健康的損害，患者本人及親屬的財產損害和精神損害。接受醫(yī)療的事實可以通過掛號、交費等診療手續(xù)來證明。 （二）醫(yī)療機構的舉證責任醫(yī)療機構是指醫(yī)院或經衛(wèi)生行政機關批準或承認的各級各類醫(yī)療衛(wèi)生技術人員。在醫(yī)療行為引起的侵權訴訟中，醫(yī)療機構應當承擔如下舉證責任：一，病員在損害結果與醫(yī)療機構的醫(yī)療行為之間不存在因果關系。侵權責任中的因果關系是指違法行為與損害結果之間的因果關系。在多數(shù)案件中，醫(yī)療行為與損害結果之間的因果關系比較明確。但在一些疑難、復雜的醫(yī)療糾紛中，必須經過專門技術鑒定方可確定因果關系。二，醫(yī)療機構不存在醫(yī)療過錯。醫(yī)療機構如果要免除自己承擔的侵權責任，就要證明自己在診療過程中不存在醫(yī)療過錯。有的學者在這方面已經作了一些探索和研究，是值得借鑒和參考的。即醫(yī)療機構證明自己沒有醫(yī)療過錯的途徑表現(xiàn)為： 1、損害結果屬于醫(yī)療意外。醫(yī)療意外是指醫(yī)療機構無法預料的原因造成的損害后果或醫(yī)療機構確實無法避免醫(yī)療損害結果； 2、出現(xiàn)了難以預料的并發(fā)癥。這種“并發(fā)癥”必須是難以預料和難以避免時，才可以成為免責的條件； 3、病員及其家屬不配合治療。如果病員及其家屬不配合治療是造成損害后果的全部原因，則可以免除醫(yī)療機構的賠償責任；如果病員及其家屬不配合治療只是損害后果的出現(xiàn)的原因之一，醫(yī)療機構也有過失時，應依過失相抵的原則，由雙方分擔責任。

因醫(yī)療行為所引起的醫(yī)療糾紛，適用舉證責任倒置的規(guī)定， 但因醫(yī)療行為以外的原因所引起的醫(yī)療機構與患者之間民事糾紛不適用舉證責任倒置的規(guī)定。 醫(yī)療損害責任糾紛案件適用舉證責任倒置原則。 患者只要舉證證明與醫(yī)療機構存在醫(yī)患關系，具有損害結果，即可完成舉證。 而醫(yī)療機構需要承擔患者損害與醫(yī)療行為不存在因果關系及不存在醫(yī)療過錯的舉證責任， 如醫(yī)療機構無法舉證，應承擔舉證不能的法律后果。