分為兩種不同情況： 一、小產(chǎn)權(quán)房的性質(zhì)是屬于履行了審批手續(xù)的房屋，但是集體經(jīng)濟組織在安置本集體村民過程中擅自擴大了銷售對象。由于根據(jù)現(xiàn)行法律和政策，非本集體經(jīng)濟組織的成員，不得購買在集體所有的土地上建設(shè)的房屋，因此買賣合同歸于無效。在此情況下，應(yīng)首先認(rèn)定所涉房屋的所有權(quán)是屬于農(nóng)村集體經(jīng)濟組織所有，或者屬于宅基地使用人所有，拆遷安置補償?shù)睦?，只能由所有?quán)人即集體經(jīng)濟組織及其成員享有。 二、小產(chǎn)權(quán)房是屬于違法建筑。對于這種情況，根據(jù)《國有土地上房屋征收與補償條例》第第二十四條 “市、縣級人民政府及其有關(guān)部門應(yīng)當(dāng)依法加強對建設(shè)活動的監(jiān)督管理，對違反城鄉(xiāng)規(guī)劃進行建設(shè)的，依法予以處理。市、縣級人民政府作出房屋征收決定前，應(yīng)當(dāng)組織有關(guān)部門依法對征收范圍內(nèi)未經(jīng)登記的建筑進行調(diào)查、認(rèn)定和處理。對認(rèn)定為合法建筑和未超過批準(zhǔn)期限的臨時建筑的，應(yīng)當(dāng)給予補償；對認(rèn)定為違法建筑和超過批準(zhǔn)期限的臨時建筑的，不予補償?！钡囊?guī)定。若涉及賠償，但標(biāo)準(zhǔn)和持國有土地使用證住房會有很大的差別。國有使用證的取得費用中包含了土地出讓金,其中包含有征地補償費、安置補助費、地上附著物補償、國土收益等。在政府拆遷中會將這部門費用根據(jù)使用年限計算,而小產(chǎn)權(quán)房遇到補償時只會支付征地補償費和安置補償費,且這個費用很大一部分要歸集體經(jīng)濟組織所有。而房產(chǎn)補償(也就是附著物補償)適用標(biāo)準(zhǔn)也不同于國有證住房。

各項征地補償費用的具體標(biāo)準(zhǔn)、金額由市、縣政府依法批準(zhǔn)的征地補償安置方案規(guī)定。土地被征用前3年平均年產(chǎn)值的確定（有關(guān)土地補償費、安置補助費的補償標(biāo)準(zhǔn)）：按當(dāng)?shù)亟y(tǒng)計部門審定的最基層單位統(tǒng)計年報和經(jīng)物價部門認(rèn)可的單價為準(zhǔn)。按規(guī)定支付的土地補償費、安置補助費尚不能使需要安置的農(nóng)民保持原有生活水平的，可增加安置補助費。