在工資糾紛中，由勞動(dòng)者舉證證明雙方存在勞動(dòng)關(guān)系；由于勞動(dòng)者工資支付憑證的制作和保存是用人單位應(yīng)承擔(dān)的一項(xiàng)法定義務(wù)，由用人單位承擔(dān)支付工資的舉證責(zé)任。用人單位必須書(shū)面記錄支付勞動(dòng)者工資的數(shù)額、時(shí)間、領(lǐng)取者的姓名以及簽字，并保存兩年以上備查。用人單位在支付工資時(shí)應(yīng)向勞動(dòng)者提供一份其個(gè)人的工資清單。

根據(jù)我國(guó)的有關(guān)司法解釋，舉證責(zé)任應(yīng)該由用人單位來(lái)承擔(dān)。我國(guó)《工資支付暫行規(guī)定》規(guī)定：用人單位可委托銀行代發(fā)工資。用人單位必須書(shū)面記錄支付勞動(dòng)者工資的數(shù)額、時(shí)間、領(lǐng)取者的姓名以及簽字，并保存兩年以上備查。用人單位在支付工資時(shí)應(yīng)向勞動(dòng)者提供一份其個(gè)人的工資清單。這就是說(shuō)，用人單位應(yīng)當(dāng)保留向勞動(dòng)者支付工資的資料至少要達(dá)到兩年。而《最高人民法院關(guān)于民事訴訟證據(jù)的若干規(guī)定》規(guī)定：有證據(jù)證明一方當(dāng)事人持有證據(jù)無(wú)正當(dāng)理由拒不提供，如果對(duì)方當(dāng)事人主張?jiān)撟C據(jù)的內(nèi)容不利于證據(jù)持有人，可以推定該主張成立。所以，對(duì)是否支付(加班)工資的勞動(dòng)爭(zhēng)議應(yīng)該由用人單位承擔(dān)舉證責(zé)任。