1、投保對象，新農(nóng)合是針對農(nóng)村人口實行的醫(yī)療制度，醫(yī)保是針對城市居民及企業(yè)職工（分為居民醫(yī)保和職工醫(yī)保兩種）。 2、繳費標準，新農(nóng)合和居民醫(yī)保的繳費雖然每年是固定的金額，但職工醫(yī)保則跟個人工資以及當?shù)仄骄べY掛鉤。 3、報銷比例，多地已開始實行城鎮(zhèn)居民醫(yī)保和新農(nóng)合統(tǒng)一的政策，新農(nóng)合的報銷比例也在逐漸往醫(yī)保報銷比例上靠近。 4、報銷范圍，醫(yī)保報銷范圍比新農(nóng)合廣，像新農(nóng)合在一些大醫(yī)院門診就不能報銷，但也是上面提到了的統(tǒng)一政策，新農(nóng)合的報銷范圍也正在向城鎮(zhèn)居民醫(yī)?？繑n。

五險里面的醫(yī)療保險和農(nóng)村合作醫(yī)療區(qū)別： 1、包含險種不同，新農(nóng)村合作醫(yī)療是由國家政策牽頭，并由當?shù)氐恼M織、引導(dǎo)的一種醫(yī)療保障體系，一般農(nóng)民多為自愿加入，不管是小病還是大病都有相應(yīng)的醫(yī)療互助互惠保障。而資金一般由政府補貼、村集體扶持、個人聯(lián)合繳費的形式，以建立最基本的社會保障形式。五險是由用人單位給予勞動者的幾種保障性待遇的合稱，包括養(yǎng)老保險、醫(yī)療保險、失業(yè)保險、工傷保險、生育保險，一般指為沒有勞動能力和沒有勞動崗位的人提供社會性的一種福利保障制度。 2、覆蓋范圍不同，新農(nóng)村合作醫(yī)療是在農(nóng)村必須是農(nóng)村戶口才能參加，當年繳費，次年需再交錢才可以享受新農(nóng)村合作聊。五險是覆蓋所有單位和職工的，參保人在完成交費年限后便可以終身獲得享受。 3、保障力度不同，新農(nóng)村合作醫(yī)療基金由于是多方籌資的關(guān)系，所以在保障力度上還稍稍欠缺了點。五險實行“低水平、廣覆蓋”的特點，因此一經(jīng)參保，標準都是統(tǒng)一享受的。