1、法律依據(jù)不同。 勞動(dòng)合同的法律依據(jù)是《勞動(dòng)法》、《勞動(dòng)合同法》等。聘用合同的法律依據(jù)是《關(guān)于在事業(yè)單位試行人員聘用制度意見的通知》和《事業(yè)單位人事管理?xiàng)l例》等。 2、法律關(guān)系主體不同。 勞動(dòng)合同用人單位一方包括企業(yè)、事業(yè)單位、國家機(jī)關(guān)，另一方是勞動(dòng)者。聘用合同用人單位為事業(yè)單位，另一方為勞動(dòng)者。 3、未簽訂合同的法律后果不同。 根據(jù)《勞動(dòng)合同法》，用人單位超過一個(gè)月不滿一年未與勞動(dòng)者簽訂勞動(dòng)合同，應(yīng)當(dāng)支付勞動(dòng)者雙倍工資，用人單位應(yīng)當(dāng)與勞動(dòng)者簽訂無固定期限勞動(dòng)合同而未簽訂的，應(yīng)向勞動(dòng)者支付雙倍工資。 4、試用期期限不同。 勞動(dòng)合同中的試用期最長不得超過六個(gè)月。聘用合同的試用期可以為12個(gè)月。 5、用人單位存在處罰權(quán)上的不同。 在勞動(dòng)合同主體上，雙方具有同等法律地位，一方無分處分另一方。在聘用合同主體關(guān)系上，用人單位可以根據(jù)聘用人員錯(cuò)誤程度，給予警告、記過、降低崗位等級(jí)或者撤職、開除的行政處分。

事業(yè)單位內(nèi)部勞動(dòng)合同制和編制區(qū)別如下： 1、工資開支來源不同：正式編制人員工資由財(cái)政撥款解決，合同制人員工資由單位預(yù)算外收入中解決。 2、福利待遇：正式編制人員的福利待遇按政策規(guī)定及上級(jí)部門規(guī)定執(zhí)行，合同制人員參照正式編人員標(biāo)準(zhǔn)執(zhí)行。 3、正式編人員可以在事業(yè)單位之間調(diào)動(dòng)，合同制人員不能。 4、正式編制人員可以提任副科級(jí)職務(wù)，合同制人員不可以。